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根據(jù)生物安全防護水平的差異，生物安全柜可分為一級、二級和三級三種類型。
一級生物安全柜
一級生物安全柜可保護工作人員和環(huán)境而不保護樣品。氣流原理和實驗室通分廚一樣，不同之處在于排氣口安裝有過濾器。所有類型的生物安全柜都在排氣和進氣口使用過濾器。一級生物安全柜本身無風機，依賴外接通風管中的風機帶動氣流，由于不能對試驗品或產(chǎn)品提供保護，目前已較少使用。
二級生物安全柜
二級生物安全柜是目前應用最為廣泛的柜型。按照《中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)標準YY0569-2005生物安全柜》中的規(guī)定，二級生物安全柜依照入口氣流風速、排氣方式和循環(huán)方式可分為4 個級別：A1 型，A2 型，B1型和B2 型。所有的二級生物安全柜都可提供工作人員、環(huán)境和產(chǎn)品的保護。
A1 型生物安全柜
A1 型生物安全柜前窗氣流速度最小量或測量平均值應至少為0.38m/s。70%氣體通過HEPA 過濾器再循環(huán)至工作區(qū)，30%的氣體通過排氣口過濾排出。
A2 型生物安全柜
A2 型生物安全柜前窗氣流速度最小量或測量平均值應至少為0.5m/s。70%氣體通過HEPA 過濾器再循環(huán)至工作區(qū)，30%的氣體通過排氣口過濾排出。
二級B型生物安全柜均為連接排氣系統(tǒng)的安全柜。連接安全柜排氣導管的風機連接緊急供應電源，目的在斷電下仍可保持安全柜負壓，以免危險氣體泄漏出實驗室。其前窗氣流速度最小量或測量平均值應至少為0.5m/s(100fpm)。
B1 型生物安全柜
B1 型生物安全柜70%氣體通過排氣口HEPA 過濾器排除，30%的氣體通過供氣口HEPA 過濾器再循環(huán)至工作區(qū)。
B2 型生物安全柜
B2 型生物安全柜為100%全排型安全柜，無內(nèi)部循環(huán)氣流，可同時提供生物性和化學性的安全控制，可以操作揮發(fā)性化學品和揮發(fā)性核放射物作為添加劑的微生物實驗。
三級生物安全柜
三級生物安全柜是為4級實驗室生物安全等級而設計的，是目前世界上最高安全防護等級的安全柜。柜體完全氣密，100%全排放式，所有氣體不參與循環(huán)，工作人員通過連接在柜體的手套進行操作，俗稱手套箱，試驗品通過雙門的傳遞箱進出安全柜以確保不受污染，適用于高風險的生物試驗。
在允許循環(huán)化學氣體的操作條件下，可以使用外接排放管道蓋的A2型二級生物安全柜。排放管道蓋與一般硬管不同的是有可吸入空氣的進氣孔；排放管道蓋與外排管道連接，然后接到一個外排風機。排放管道蓋上的進氣孔對于A2型二級生物安全柜通過內(nèi)置風機保持進氣流和下沉氣流的平衡至關重要。如果使用密封的外接風管，進氣流將會過強可能導致安全柜對產(chǎn)品的保護失效；而排放管道蓋上的進氣孔可以從室內(nèi)吸入空氣，而不會影響安全柜內(nèi)的氣流平衡。此條件只適用于微量有毒化學物質(zhì)。
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